Основной всего процесса селекции является отбор отдельных растений с улучшенными показателями и признаками из большого числа перекрестных потомков. Для многих таких признаков были идентифицированы и сопоставлены гены с их местоположением в геноме растений. Вариации генов или локусов генов внутри цепочки ДНК, которые коррелируют с различными фенотипами растений (пр. восприимчивость или устойчивость к тому или иному заболеванию), могут быть использованы в качестве т.н. «генетических маркеров»

Используя эти маркеры, можно прогнозировать качественные характеристики растения, зависящие от наличия или отсутствия определенных признаков, без необходимости проведения длительных и трудоемких испытаний на устойчивость к болезням или иных тестов в теплице, в полевых условиях.

В нашей селекционной программе активно используется селекция с помощью маркеров. Они используются для закрепления отдельных признаков, таких как устойчивость к болезням. Кроме того, используются методы «широкого отбора» по всему геному для передачи сложных признаков, таких как урожай. В рамках нашей научной-практической деятельности по разработке и идентификации новых маркеров для текущих, будущих задач селекции, мы используем комбинации генетических, геномных и биоинформационных подходов.